二氧化氯具有殺jun、漂白、除臭、消毒、保鮮的功能。主要是因為二氧化氯具有氧化作用，二氧化氯分子的電子結構呈不飽和狀態，外層共有19個電子，具有強烈的氧化性，主要是對富有電子（或供電子）的原子基團（如含巰基的酶和硫化物，氯化物）進行攻擊，強行掠奪電子，使之成為失去活性和改變性質的物質。

殺jun、消毒方面

對飲用水的消毒 二氧化氯是凈化飲用水的一種十分有效的凈水劑，其中包括良好的除臭與脫色能力、低濃度下殺jun和殺病du能力。二氧化氯用于水消毒，在其濃度為0.5～1mg/L時，1分鐘內能將水中99%的細菌殺滅，滅菌效果為氯氣的10倍，次氯酸鈉的2倍，抑制病du的能力也比氯高3倍，比臭氧高1.9倍。二氧化氯還有殺jun快速，pH范圍廣（6-10），不受水硬度和鹽份多少的影響，能維持長時間的殺jun作用，能率地消滅原生動物、孢子、霉菌、水藻和生物膜，不生成氯代酚和三鹵甲烷，能將許多有機化合物氧化，從而降低水的毒性和誘變性質等多種特點。

在醫療領域 二氧化氯用于口腔含漱，可有效控制牙齦炎、牙斑菌和口臭，用作坐浴或沖洗，可防止多種疾病，等等。在1998年抗洪救災中，抗洪戰士用二氧化氯消毒液洗臉、坐浴、擦身、泡腳、泡洗內衣褲等，其神奇作用再次被驗證。實踐證明，二氧化氯對防治紅眼病、皮膚病及除臭有良好效果。